Finalmente posso cancelar meu pacote de hospedagem no UOL Host. A última ponta solta, fazer o Etherpad funcionar corretamente dentro do Pydio, foi resolvida ontem.
Agora tenho tudo funcionando no meu servidor caseiro, com proxy via Nginx instalado no servidor da Digital Ocean.
Como brinde ainda tenho alguma linhas de código para doar ao projeto Pydio.